Het Ministerie van Veiligheid en Justitie steunt het Meldpunt met subsidie. Daarnaast vindt er regelmatig overleg plaats tussen het Meldpunt en het Ministerie over zaken betreffende seksueel misbruik van kinderen op internet, cybercrime en aanverwante zaken.

Het Meldpunt maakt onderdeel uit van het Safer Internet Plan (SIP) en wordt binnen dit programma gesubsidieerd door de Europese Commissie. Het SIP is gericht op bescherming van minderjarigen (kwetsbare leden van de samenleving), bevorderen van veilig internetgebruik, bescherming van kinderen op internet en bestrijding van illegale, schadelijke en ongewenste inhoud als onderdeel van een integrale aanpak vanuit de EU.